中国医学科学院输血研究所（以下简称输血所）始建于1957年，1965年从中国医学科学院输血及血液学研究所拆分出来，由天津迁到四川成都，成为一个独立研究所。作为我国唯一的国家级输血医学研究机构，主要从事输血医学科学研究、输血相关技术研究，为国家血液安全管理、应急医疗体系建设、输血科学技术发展及全民知识普及等方面提供信息咨询和技术支持。
       输血所占地46066.7m²，其中净用地面积36099.12m²，总建筑面积23029m²，总资产5.2亿元。现有在职职工142人，其中，中高级职称人员95人。一线科研人员中，具有研究生以上学历人员占83.05%。
输血所的科研体系由输血传播疾病、干细胞与再生医学、细胞与基因治疗、输血医学工程、血浆蛋白质、临床输血、血液资源管理7个科研中心和2个服务平台（中心实验室、实验动物中心）构成。设有原卫生部批准的HLA参比实验室、原国家卫计委批准的核酸参比实验室、中国医学科学院输血不良反应重点实验室、四川省血液安全与血液替代国际科技合作基地、四川省血浆蛋白质医学重点实验室、四川省输血传播疾病医学重点实验室、中国红十字总会批准的中国干细胞捐献者资料库组织配型实验室、以及输血系统最早的艾滋病确证实验室。
       作为北京协和医学院的免疫学、病原生物学、生物化学与分子生物学、遗传学等专业的博（硕）士授予点，自1979年招生以来，累计培养博（硕）士研究生200余人。2013年，以输血所为依托成立了北京协和医学院输血医学系，并于2015年首次招收输血医学专业博（硕）士研究生。目前输血所共有博士生导师8人，硕士生导师26人，每年在培博（硕）士研究生60余人。
       输血所在血液管理信息化建设、无偿献血促进、行业政策法规、行业研究、行业培训、行业督导等方面开展了多项工作。2014年，输血所获批成立“四川省血液安全管理中心”。
       输血所是中国输血协会细胞治疗专业委员会、教育工作委员会，中华预防医学会血液安全专业委员会，中国生物医学工程学会血液疗法与工程分会，中国疫苗行业协会血液制品分会的依托单位。承担国内输血医学专业的全国性学术刊物《中国输血杂志》的编辑出版任务，也是《国际输血与血液学》的主办单位之一。