
该研究通过转录组测序(RNAseq)筛选获得1062了个受IFNα显著调节的长链非编码RNA(lncRNA)。其中,lncRNA RP11-288L9.4的表达在IFNα处理后升高最为显著。通过生物信息学分析,发现该lncRNA位于干扰素刺激基因IFI6的内含子1,与其反义链部分重叠,因此将其命名为lncRNA-IFI6。对lncRNA-IFI6功能研究显示,lncRNA-IFI6高表达能促进丙肝病毒(HCV)的复制;通过CRISPR/Cas9 gRNA将其敲低,显著抑制HCV的复制。进一步研究显示lncRNA-IFI6对HCV的调控不依赖于Jak/Stat信号通路,而是通过调节IFI6转录起始位点组蛋白修饰,对其表达进行特异性负调控,进而促进HCV的复制。
近年来, 直接抗病毒(DAAs)药物极大地提高了HCV的治疗效果,有研究显示,DAAs治疗中宿主的先天免疫发生了显著的改变,因此,该研究为深入了解lncRNA与宿主先天免疫以及丙肝治疗疗效相关性提供了依据。陈利民教授团队段晓琼博士是该论文的共同一作,该团队海外合作学者林温育博士为共同通讯作者。
全文链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30199576